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La description
Ce cours vous donne une introduction à Python, où nous avons couvert les bases du langage, notamment:
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Syntaxe de base,
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Types variables,
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Opérateurs de base,
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Prise de décision, et
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Boucles.
Puis à l’étape où Python est utilisé pour explorer les codes biopython, puis les combiner pour effectuer des tâches bioinformatiques de routine, ce qui comprend:
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Rechercher et obtenir des données à partir des bases de données NCBI via la connexion Internet,
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Traiter les fichiers de séquence comme la lecture, l’écriture et la conversion,
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Traiter des séquences comme la manipulation et l’analyse,
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Réaliser l’alignement des séquences par paires (global et local),
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Exécution de l’alignement de séquences multiples (MSA) et traitement des fichiers au format MSA et Newick, et
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Enfin, effectuer BLAST en ligne et hors ligne, puis analyser les résultats.
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