La description

Ce cours vous donne une introduction à Python, où nous avons couvert les bases du langage, notamment:

1. Syntaxe de base,

2. Types variables,

3. Opérateurs de base,

4. Prise de décision, et

5. Boucles.

Puis à l’étape où Python est utilisé pour explorer les codes biopython, puis les combiner pour effectuer des tâches bioinformatiques de routine, ce qui comprend:

1. Rechercher et obtenir des données à partir des bases de données NCBI via la connexion Internet,

2. Traiter les fichiers de séquence comme la lecture, l’écriture et la conversion,

3. Traiter des séquences comme la manipulation et l’analyse,

4. Réaliser l’alignement des séquences par paires (global et local),

5. Exécution de l’alignement de séquences multiples (MSA) et traitement des fichiers au format MSA et Newick, et

6. Enfin, effectuer BLAST en ligne et hors ligne, puis analyser les résultats.